| 三维分子类 |
|
| RASMOL 2.7.4.2 |
观看生物分子3D微观立体结构的软件。 |
| RasTop 2.2 |
为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件 |
| MolMol 2k.2 |
将pdb等格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件。 |
| CrystInfo 1.0 |
用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3d结构。 |
| DS Visualizer 2.01 |
3维分子浏览工具。 |
| DS Visualizer ActiveX Control 2.01 |
三维分子显示控件。 |
| ICM-Browser 3.5 1P |
3维分子浏览工具。 |
| VMD 1.8.6 |
3维分子浏览工具，可以进行动态显示。 |
| CN3D 4.1 |
3D分子结构观察软件。 |
| WPDB 2.2 |
PDB文件检索显示分析软件。 |
| DTMM 4.3 Demo |
3维分子模型显示、编辑与构建程序。 |
| gopenmol 3.0 |
显示并分析分子结构及其特性的软件。 |
| POV-Ray 3.7b27 |
生成三维图像工具软件。 |
| MegaPov 1.2.1 |
3D渲染软件POV-Ray非官方编译软件。 |
| Mol2Mol 5.6.0Demo |
分子文件格式转换软件。 |
| MolPOV 2.0.8 |
将PDB文件转化为POV格式文件的软件。 |
| PovChem 2.1.1 |
将PDB文件转化为POV格式文件的软件。 |
| Ortep-3 2.00 |
生成分子的热椭圆形点图软件。 |
| PLATON 1.13 |
通用结晶学软件工具。 |
| Mage 6.44 |
读取并演示Kinemage格式文件的专用软件。 |
| Prekin 6.42 |
将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件的软件。 |
| KiNG 2.13 |
三维分子Kinemage的显示软件。 |
| Swiss-PdbViewer 4.0 |
PDB文件显示与分析软件。 |
| StrukEd Demo |
化学分子编辑与三维模型生成软件。 |
| JMVC 4 041122版 |
使用JAVA技术编写的三维分子查看器。 |
| Re_View 1.0 |
读取及分析XYZ格式三维分子文件的软件。 |
| Oscail X 2008 |
用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包。 |
| Moilin X 2008 |
分子构建与观察软件。 |
| Tinker 4.2 |
与Moilin配套的DOS下的分子设计建模软件。 |
| Biodesigner 0.75 |
免费的分子建模与显示软件。 |
| MoluCAD Demo 02年11月版 |
全功能的分子建模与显示工具软件。 |
| ACD/3D Viewer for ISIS 4.5 |
免费的ISIS Draw三维显示插件。 |
| PyMOL 0.99rc6 |
免费且公开源代码的三维分子显示、动画、编辑程序。 |
| Qmol 4.01 |
基于OpenGL的三维分子显示软件。 |
| Protein Explorer 2.80 |
RASMOL衍生出的软件。 |
| Chimera 1.2540 |
免费的交互式分子模型显示程序；和 |
| Jmol 11.4.6 |
java语言写成的开放源代码的免费三维分子显示程序； |
| Ramachandran Plot Explorer 1.0 |
蛋白分子显示软件； |
| ProteinScope LE 1.0.5 |
免费PDB蛋白三维显示软件 |
| CHIME 2.6 SP7 |
直接在浏览器中观看3D分子。 |
| YASARA View 8.6.29 |
免费分子显示软件 |
| NOC 3.01 |
免费的蛋白3维结构构建、显示、分析软件2； |
| 3DNA 1.5 |
分析、构建、显示核酸三维结构的软件， |
| ArgusLab 4.0.1 |
分子构型、绘图和药物设计软件； |
| CueMol 1.1.0.182 |
免费的分子结构显示和三维渲染软件； |
| jimp 2 0.091 |
显示三维分子软件； |
| SweetMollyGrace 1.2 |
三维分子渲染与动画软件； |
| Facio 11.7.1 |
三维分子建模、显示与量子化学计算程序； |
| VEGA ZZ 2.2.0 |
支持多种三维格式并可进行显示、计算、分析的免费软件； |
| GDIS 0.773 |
三维分子显示软件。 |
| PDBlib 2.2 |
显示PDB文件的C++库，可用于编程。 |
Ascalaph 1.1.3 Demo
|
三维分子显示软件 和分子设计建模软件。 |
| QuteMol 0.4.1 |
开源的三维分子显示软件。 |
| BALLView 1.2 |
分子三维建模、显示软件 |
| DNA分析 |
|
| JaMBW 1.1 |
分子生物学软件包。 |
| ANNHYB 4.941 |
用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件。 |
| Chromas 2.33 |
ABI格式文件显示与编辑软件。 |
| DnaSP4.50.3 |
基因多态性分析软件。 |
| DFW 2.51 trail |
DNA分析软件。 |
| Artemis R10 |
以Java语言写成的序列查看工具。 |
| ACT R7 |
以Java语言写成的序列比较查看器。 |
| GDA 1.1 |
主要用来进行不连续基因数据的统计分析。 |
| Sequencher 4.8 Demo |
序列拼接软件。 |
| MeltCalc 2.06 |
自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件。 |
| ConsInspector 3.3 |
DNA蛋白结合位点预测识别软件。 |
| GenomePixelizer 2003.10.1版 |
帮助理解基因组中的簇基因（clustering gene）之间的相互关系的软件。 |
| Gene Construction Kit 3.0b16 Demo |
管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件。 |
| GenescanView 1.2 |
查看基因扫描（genescan）格式.fsa文件的小软件。 |
| Sequin 8.10 |
数据库GenBank, EMBL, DDBJ 查询软件。 |
| DNAuser 1.0 |
DNA序列处理软件。 |
| GenomeComp 1.3 |
中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物基因组比较工具 |
| Apollo 1.9.3 |
Java语言开发的基因组注释显示编辑软件 |
| SNPHunter 1.75 |
SNP（单核苷酸多态性）查找软件。 |
| SSRHunter 1.3 |
SSR（Simple Sequence Repeat，即简单序列重复，又称微卫星DNA）位点查找软件。 |
| iCE 3.5 |
Java语言编写的显示基因指纹图及相关数据的软件 |
| MB6.84 |
免费的DNA分析软件 |
| FinchTV 1.4 |
免费的DNA图谱分析软件； |
| Sequence Scanner v1.0 |
显示分析ABI基因分析仪DNA图谱数据软件， |
| CodonCode Aligner 2.0.6 |
DNA测序trace图编辑、突变分析、contig编辑、序列拼接软件。 |
| WinGene 2.31 |
分析核酸序列的多用工具软件； |
| BioLign 4.0.6 |
还增加免费序列拼接软件； |
| PIC_Calc 0.6 |
多态信息含量计算程序。 |
| SequenceViewer 1.0 |
DNA序列图形显示软件； |
| SERIAL CLONER 1.3 |
DNA序列分析工具软件 |
| Xplorer 2.4.2 |
DNA图谱查看分析软件 |
| DNA Counter v1.0.2 |
统计DNA序列各核苷酸百分比软件。 |
| Chromatogram Explorer 2.0 |
显示、处理序列层析图谱文件软件。 |
| NSA 3.3 |
核酸序列分析软件。 |
| 生物化工 |
|
| brd 4.0 |
生物反应器（发酵罐）设计软件。 |
| BioStat 4.4 |
BioStat B发酵罐控制程序。 |
| PenSim v2.0 |
青霉素发酵模拟软件。 |
| SuperPro Designer 7.5b06 评估版 |
计算机辅助设计特别是生物工艺设计的软件包。 |
| FRAE 2.01 |
发酵记录分析专家。 |
| 进化分析 |
|
| WINIPAUP 1.0 |
PAUP软件WINDOWS介面软件。 |
| phylip 3.65 |
进化树分析软件，并可绘制进化树。 |
| TreeView 1.6.6 |
进化树处理软件。 |
| GeneTree 1.3 |
比较基因与种系进化树的程序。 |
| NDE 0.5.0 |
用来编辑NEXUS格式文件的程序。 |
| TreeMap 1.0 |
用来可视地比较主、从进化树的程序。 |
| Spectrum |
分析进化信息而不用将之转化为进化树的软件。 |
| Phyltools 1.32 |
计算与处理进化树数据的软件。 |
| tree-puzzle 5.2 |
核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具。 |
| ATV 4.0a13 |
JAVA语言编写的显示"New Hampshire"与NHX格式的进化树文件软件。 |
| TREECON 1.3b Demo |
构建和绘制进化树的软件包。 |
| COMPONENT 2.0 |
分析进化树免费软件。 |
| NJplot |
小巧的显示进化树的免费软件NJplot。 |
| MEGA 4.1b |
免费分子进化遗传分析软件 |
| PAUP 4 |
PAUP的快速使用手册 |
| TreeSAAP 3.2 |
蛋白序列进化分析软件； |
| mesquite 2.5 |
进化分析软件 |
| PAL 1.51 |
进化分析java程序库； |
| Vanilla 1.2 |
使用PAL编写的进化分析命令行程序； |
| SplitsTree 4.10 |
JAVA程序编写的分析和显示进化数据软件； |
| TCS 1.21 |
JAVA程序所写的进化网络分析软件； |
| GEODIS 2.5 |
进化分析软件； |
| RDP 3b28 |
重组分析软件 |
| FastME 1.0 |
快速精确的进化树软件； |
| REAP |
DOS下的进化分析软件包； |
| T-REX 4.01 |
进化树构建分析软件； |
| FSTAT 2.9.3.2 |
基因差异分析软件； |
| ProfDist 0.9.7 |
构建大进化树软件 |
| STC 1.2 |
新的算法构建进化分析软件， |
| SymmeTREE |
命令行差异分析软件 |
| Phylogenetic Visualization tool |
进化树显示工具 |
| TREEFINDER 200806版 |
计算进化分析软件 |
| PHASE 2.0 |
序列进化分析软件； |
| BAMBE 2.01b |
分子生物进化分析软件； |
| MODELTEST 3.7 |
核苷酸替换DNA进化最优模型分析软件 |
| MTgui 1.5 |
MODELTEST图形操作介面软件 |
| Clann 3.13 |
以色列科学家编写进化树分析软件； |
| Phylogenetic Independence 2.0 |
进化独立性分析软件 ； |
| Jevtrace2 v3.12b |
JAVA语言写的进化分析软件； |
| NimbleTree 2.6 |
建立进化树软件； |
| Phyl-O-Gen 1.1 |
构建进化树软件； |
| BEAST 1.4.7b |
贝叶斯进化分析软件 |
| MESA 1.9.23 |
宏进化分析和模拟软件； |
| TreeJuxtaposer 2.1 |
进化树比较分析软件； |
| TreeExplorer 2.12 |
进化树绘制显示软件； |
| TreeMe 04/2008 |
进化树生成和显示软件； |
| DNATREE 1.2 |
DNA序列进化分析软件 |
| Genie 3.0 |
系谱间隔分析软件 |
| Pebble v1.0 |
进化分析软件； |
| ArboDraw |
进化树绘图软件 |
| PhyloDraw 0.82 |
进化树绘图软件. |
| MrBayes 3.1.2 |
进化树分析软件； |
| Network 4.501 |
进化树生成软件； |
| PhyDE 0.995 |
进化数据编辑器； |
| PRAP 1.21 |
Parsimony ratchet分析软件 |
| PPG 1.2.0 |
制作系统发育图谱软件。 |
| 图像处理 |
|
| Image Tool 3.0 |
科学用途的处理图像软件。 |
| Image J 1.40 |
用Java语言写成的科学用途的处理图像软件。 |
| Cross Checker 2.91 |
基因指纹图分析软件。 |
| ALFmap 1.22 |
ALF (Amersham Pharmacia) 图像格式转换软件。 |
| Band Leader 3.0 |
凝胶图像处理软件。 |
| Scion Image 4.03 |
图像处理与分析工具。 |
| OSIRIS 4.19 |
通用医学图像处理与分析软件。 |
| Melanie Viewer 6.0 |
免费Melanie图像查看器。 |
| TotalLab v2006c 评估版 |
图像分析软件。 |
| QuantiScan 3.0 Demo |
使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件。 |
| Engauge Digitizer 4.1 |
图形数字化软件。可以将曲线图转化为数据与等式。 |
| Graph Digitizer version 2.16 |
图形数字化软件。 |
| Peak Explorer 2.11 |
处理试验图谱图像软件。 |
| Volocity LE 4.3.2 |
免费显微图像处理软件。 |
| GetData 2.24 |
图像数字化处理软件。 |
| Bersoft Image Measurement 5.21 |
图像数字化处理软件。 |
| DigitizeIt 1.5 |
图像数字化处理软件。 |
| CellC v1.2 |
微生物显微图像处理软件。 |
| LabImage 4.0 评估版 |
凝胶图像分析软件。 |
| Grid cell counter 08.04.08版 |
免费细胞图像分割计数软件 。 |
| BioImageXD Beta r1401 |
免费生物医学图像处理。 |
| 化学应用 |
|
| mmcalc 1.8 |
分子量计算器。 |
| Chemical Calculator 6.0 |
化学试剂制备计算器。 |
| periodic table 1.1 |
小巧的元素周期表。 |
| Periodic Table 3.54 se |
高级元素周期表。 |
| CFT 1.3 |
化学式教师。 |
| CRS 1.3 |
化学反应方程式配平器 |
| Model ChemLab v2.5体验版 |
化学实验教育软件及其汉化版 |
| 化学品电子手册 3.0 |
本电子手册是一个综合性的化学品手册。 |
| Molecular Weight Calculator 6.42 |
免费的分子量计算器。 |
| 序列比对综合分析 |
|
| Geneious 3.8.5 |
序列综合分析软件； |
| MACAW 2.05 |
多序列构建与分析软件。 |
| Clustal W 2.0.7 |
用来对核酸与蛋白序列进行多序列比较的软件。 |
| Clustal X 2.0.7 |
Clustal W Windows界面程序。 |
| FASTA 35.3.6 |
数据库中查找同源序列软件。 |
| GeneDoc 2.7.0 |
对序列进行相关分析等操作。 |
| BLAST 2.2.18 与NetBlast2.2.18 |
数据库中查找类似序列的软件及客户端软件。 |
| SeqPup 0.9 |
生物分子序列编辑与分析软件。 |
| K-Estimator 6.1 |
进化基因学研究软件，评估两条核酸序列核苷酸替代数。 |
| BioEdit 7.0.9 |
序列编辑器与分析工具软件。 |
| DAMBE 4.5.67 |
综合性序列工具软件。 |
| SeaView 2.2 |
图形化多序列队列编辑器。 |
| Jalview 2.3 |
用Java语言写的多序列队列编辑器。 |
| DNASIS Max Trail 2.9 |
序列综合分析工具。 |
| Genamics Expression 1.1 演示版 |
是一个DNA与蛋白序列分析工具。 |
| Vector NTI Viewer 4.0.1 |
载体查看软件。 |
| Jellyfish 3.3.1 |
多功能序列分析软件。 |
| ProSeq 3.0 test |
核酸序列编辑与种群遗传学分析软件。 |
| SMS 2 |
DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具集合。 |
| Staden 1.6.0 |
综合序列装配、编辑、分析软件包。 |
| Vector NTI Advance 10.3.0 Demo |
综合性蛋白核酸分析工具包。 |
| ISYS v1.35 |
NCGR开发的用JAVA语言写成的数个不同类生物信息软件与数据库的软件集合平台。 |
| DNAScriptor 1.00 |
DNA与蛋白序列综合分析软件。 |
| PhyloGrapher（2003.4.3） |
用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件。 |
| bioxm 2.6 |
DNA序列资料的常规分析软件。 |
| SeWeR 3.0 |
基于WEB的常用序列分析工具集。 |
| WinBlast v.0.2.0 |
免费的NCBI BLAST程序windows界面程序。 |
| SeqVISTA 1.81 |
java语言编写的核酸或蛋白序列图像显示、比较软件 |
| GENOME EXPLORER 1.0b |
Java语言编写的生物信息学综合工具软件 |
| PowerBlast 1.2.0 |
序列比较分析软件Blast的扩展软件 |
| JAligner 1.0 |
基于Smith-Waterman算法的序列比对软件 |
| DNAMAN 6.0 Demo |
多功能综合序列分析软件演示版 |
| CLC Free Workbench 4.6 |
免费的生物信息学综合软件。 |
| MAFFT 6.522 |
多序列比对软件。 |
| TuneClustalX |
多序列比对软件 |
| Exonerate 1.3.0 |
比对软件 |
| Lalnview 3.0 |
双序列比对图形显示软件； |
| NeoBio 1.0 pre-alpha |
序列比对java软件； |
| STRAP 07.10版 |
多序列比对交互软件。 |
| Mauve 2.1.1 |
基因组比对软件； |
| Laj 05.11.4 |
用来处理、显示比对结果的软件； |
| YASS v1.12 |
本地序列比对工具软件 |
| Utopia 1.3.0 |
包括三维显示软件Ambrosia和比对结果显示软件cinema的软件； |
| MolQuest trial 1.6.3 |
生物信息学工具软件包； |
| GENtle 1.9.4 |
免费的DNA和蛋白序列编辑管理软件 |
| Align-m v2.3 |
多序列比对软件 |
| DNA Baser v2.60.80 |
多序列比对软件 全功能试用版。 |
| QAlign 2.10 |
多序列比对与编辑软件 |
| seqtools v. 8.4.040 |
核酸蛋白序列编辑分析软件。 |
| BlastViewer 2.2 |
比对结果分析软件 |
| 数据处理 |
|
| GraphPad PRISM 5.0 Demo |
著名的数据处理软件。免费的Prism 文件浏览器Free Prism Viewer 4.01。 |
| SigmaStat 3.5 Demo |
智能统计软件 30天全功能演示版。 |
| PeakFit 4.12 Demo |
自动分离、拟合与分析非线性数据软件。 |
| CurveExpert 1.38 |
实验数据处理绘图软件。 |
| DRS 2005 |
依据"最小三乘法"编制的数据回归分析软件。 |
| TDMA 1.03 |
二剂量法生物效价测定软件 |
| LD50 1.01 |
LD50数据处理程序 |
| shyfxExcel 3.1 |
农业试验统计分析软件 |
| GOSA-fit 3.b20070606 |
非线性拟合程序 |
| biostat 2007 3.8.2 |
生物医学统计学软件 |
| 杂七杂八 |
|
| DynaFit 3.28.054 |
(生物)化学动力学与化学平衡计算程序。 |
| Migrate 2.4.4 |
从遗传学角度，估算人口移民率程序。 |
| arlequin 3.11 |
人口遗传学软件 |
| FBAT 2.0.2C |
家族遗传相联检验的统计程序。 |
| GGT 2.0 |
图形化基因型表示软件。 |
| CERVUS 3.0 |
使用共显性标记数据推断亲缘关系的软件。 |
| SBW 2.7.7 |
系统生物学软件包。 |
| Gepasi 3.30 |
化学与生物化学反应动力学仿真与优化软件。 |
| Map Manager QTX b20 |
回交、杂交与重组自交系分析遗传作图实验结果的软件。 |
| FCSM |
用来管理储存在液氮容器中的生物样品（例如细胞系、血清等等）的程序。 |
| MICE 1.4 |
虚拟动物饲养设施，用来帮助管理饲养设施中的实验动物软件。 |
| DBsolve 7.45 |
代谢及酶-受体结合模拟软件。 |
| boxit 2007 DEMO |
管理生物样品的数据库系统。 |
| GRR 1.2.1.41 |
检测系谱误差(pedigree errors)的应用软件。 |
| AceDB 4.9u |
基因组数据库软件。 |
| MAPL98、DIAL98与GEST98 |
日本学者编制的几个统计基因学（Statistical Genetics ）软件。 |
| PED 4.2 |
系谱(Pedigree)绘制软件。 |
| PEDRAW 2.5 |
系谱(Pedigree)绘制软件。 |
| MassXpert 1.7.6 |
帮助科学家预测与分析从蛋白组学研究中获得的蛋白质质谱数据的软件。 |
| WinMDI ver 2.9 |
分析流式细胞仪数据文件的免费软件 。 |
| TestDNA |
根据已知成份值生成细胞周期FCS文件的免费工具软件。 |
| Cylchred 1.0.2 |
细胞周期分析（CELL CYCLE ANALYSIS）软件。 |
| Flow Cytometer Simulator |
流式细胞仪模拟软件 |
| FCS File Mixer和FCS File Sanitizer |
两个流式细胞仪相关免费软件。 |
| 生物五笔2002f |
生物医学专业输入法 。 |
| MapDraw 2.1 |
遗传连锁图绘制软件。 |
| E-Cell 3.1.105 |
对生物细胞等大型复杂系统进行建模，模拟和分析软件。 |
| 生物医学计算器(BioMedCalc)2.9 |
用于生物医学计算的生物信息学专业软件。 |
| WEASEL 2.5 |
JAVA语言写的流式细胞分析软件。 |
| REtools 2.01 |
实验室限制酶管理软件。 |
| PEDIGREE VIEWER 5.5 |
制遗传图谱软件 ； |
| ezFreezer 1.4.4 Demo |
冷冻管管理软件 。 |
| FCSExpress V3 Demo |
流式细胞仪数据分析软件。 |
| Pegasys 0.6 |
生物信息学流程管理软件 |
| BioDownloader |
生物下载器 |
| Pathway Studio 5.0 Trail |
代谢途径分析和显示软件； |
| Cytoscape 2.6.0 |
java语言编写的显示生物分子交互作用网络的生物信息学软件； |
| Taverna 1.7 |
在生物信息学研究中使用工作流和分布计算技术工具软件 |
| APP 2.06 |
免费的免费的途径绘制显示软件 |
| EPE 1.3.0 |
注释、显示各种生物网络、途径的软件 |
| BioKnow-Reagent |
百奥知试剂耗材管理软件 |
| MetaPAT 07.02版 |
代谢途径比对软件 |
| bioedic 2008.0.0.0.11 |
生物学词典软件生物易典。 |
| BiblioSphere |
生物途径和基因组分析工具。 |
| CFC 1.0 |
遗传图谱分析、绘制制图软件。 |
| MultiQC 5.4.0.10 |
医学实验室质量控制软件。 |
| Progeny 7 试用版 |
谱系分析/绘制/管理软件 |
