DeepView - Swiss-PdbViewer is an application that provides a user friendly interface allowing to analyze several proteins at the same time. The proteins can be superimposed in order to deduce structural alignments and compare their active sites or any other relevant parts. Amino acid mutations, H-bonds, angles and distances between atoms are easy to obtain thanks to the intuitive graphic and menu interface.
是一个界面非常友好的应用程序,使用起来比RASMOL方便,用来同时分析几个蛋白PDB文件。可以将几个蛋白叠加起来用来分析结构类似性,比较活性位点或其它有关位点。通过菜单操作与直观的图形,可以很容易获得氢键、角度、原子距离、氨基酸突变等数据。该软件与Swiss-Model服务器(蛋白立体结构构建服务器)紧密关联,可以从软件直接连到Swiss-Model服务器进行理论蛋白立体结构构建。而且,该软件可以调用POV-Ray软件(见上)生成质量非常高的蛋白图像。下载Swiss-PdbViewer Loop Database,2.45M,用于独立构建PDB文件与教学。本软件最新版增加了PROSITE pattern检索功能,需要下载Prosite.dat(17.11版,Prosite的使用手册(45K),说明文件(3M)4.8M,拷贝至usrstuff目录后供程序检索调用。使用手册,740K。Swiss-PdbViewer 3.7 汉化版,750K。