K-Estimator is a program to estimate the number of synonymous (Ks) and nonsynonymous substitutions (Ka) per site and the confidence intervals by Monte Carlo simulations.
当对两个核酸序列进行比对时，K-Estimator用来评估两者核苷酸替代数（趋异性），包括蛋白编码区与非蛋白编码区。使用Monte Carlo模拟估算可信区间。在分子进化研究中，评估两条核酸序列的被替换核苷酸数量是一个中心课题。精确量化这些数据将直接影响广泛应用于进化基因学的许多实验的可靠性。对蛋白编码区，分为两种情况，一种是核苷酸替换不造成氨基酸改变，称为同义替代（synonymous)，另一种情况为核苷酸替换造成氨基酸改变，称为非同义替代（nonsynonymous)，必须分别评估这种核苷酸替代数量。每个位点同义替代数量用Ks表示，非同义替代数量用Ka表示。对非蛋白编码区，总替代数为K。K-Estimator 便是用来计算K.Ka,Ks及可信区间的应用软件。
